Для уничтожения вредителей применяются физико-механические и химические меры борьбы. К физико-механическим мерам борьбы относятся: сбор вредителей совками, пылесосом, сушка, охлаждение, промораживание. Крупу очищают от вредителей на зерноочистительных машинах или транспортерах, а муку и некоторые виды круп (манную, ячневую) просеивают на ситах. Отходы, полученные при просеивании, уничтожают.
Для уничтожения вредителей применяются действия низких или высоких температур. В зимний период муку и крупу охлаждают, усиленно проветривают склады, а также снижают высоту штабеля. При температуре ниже 0° многие вредители погибают. Применяют также сушку продуктов при температуре 40—50° в специальных сушилках или на солнце. После сушки продукт обезвреживается.
Наиболее сильным средством борьбы с вредителями является применение химических веществ, например бромистого метила, хлорпикрина и т. д. Однако эти вещества ядовиты и поэтому применяются как средства борьбы только работниками дезинсекционных станций.